Inicjatywa wskrzeszenia piłki młodzieżowej w blisko 70-letniej historii Klubu miała miejsce przynajmniej kilkukrotnie. Nigdy jednak do 2012 roku w Lotniku nie funkcjonował więcej jak jeden zespół młodzieżowy, czy to w kategorii juniorskiej czy piłki dziecięcej. Wszystko zmieniło się 6 lat temu i od tego czasu kolejne roczniki osiągają co raz to lepsze wyniki, które doprowadziły wreszcie do 3. miejsca w województwie, jakie Lotnik osiągnął w 2016 roku z grona ponad 800 drużyn rywalizujących w turnieju "Wakacje z Piłką Nożną".
Do dnia dzisiejszego grupy młodzieżowe Lotnika m.in. sześciokrotnie cieszyły się z awansów do wyższych klas rozgrywkowych, notując po drodze wiele znakomitych występów na turniejach rangi powiatowej, wojewódzkiej, ogólnopolskiej czy w zawodach międzynarodowych. Ale po kolei:
Sezon 2012/13:
- II miejsce w turnieju Pcimianka Cup kat. orliki
- występy drużyn orlików i powstałej na wiosnę 2013 r. drużyny żaków
- rywalizacja z takimi drużynami jak Wisła Kraków, Cracovia, AP 21 Kraków
Sezon 2013/14:
- X miejsce młodzików w Wojewódzkim Finale Turnieju "Wakacje z Piłką Nożną"
- III miejsce w turnieju młodzików z okazji 60-lecia Krakus Nowa Huta
- występy drużyn żaków, orlików i młodzików
- rywalizacja z takimi drużynami jak Resovia Rzeszów, Wisła Kraków
Sezon 2014/15:
- I miejsce młodzików w turnieju gminnym "Wakacje z Piłką Nożną"
- III miejsce żaków w turnieju Kmita Cup
- II miejsce orlików w turnieju Sankovia Cup
- IX miejsce młodzików w Ogólnopolskim Turnieju Resovia Winter Cup
- 1. międzynarodowy mecz w historii Klubu z Karpatami Lwów porażka 0:1
- III miejsce trampkarzy w turnieju Lokomotywa Cup
- III miejsce orlików w turnieju Kryspinów Cup
- mistrzostwo III ligi i awans drużyny młodzików do II ligi
- występy drużyn żaków, orlików, młodzików i trampkarzy
- rywalizacja z takimi drużynami jak Karpaty Lwów, KSZO Ostrowiec Św., Polonia Warszawa, Sandecja Nowy Sącz, Wisła Kraków, Podbeskidzie Bielsko-Biała
Sezon 2015/16:
- I miejsce młodzików w turnieju gminnym "Wakacje z Piłką Nożną"
- I miejsce młodzików w turnieju Kmita Cup
- VI miejsce orlików w międzynarodowym Turnieju Mikołajkowym w Pleśnej
- mecze z Partizanem Bardejov i FAMT Preszów
- mistrzostwo Krakowa młodzików w Turnieju Deichmanna
- występy drużyn żaków, orlików, młodzików i juniorów młodszych
- rywalizacja z takimi drużynami jak Śląsk Wrocław, Korona Kielce, Zagłębie Sosnowiec, Podbeskidzie Bielsko-Biała, Cracovia, Wisła Kraków, GKS Katowice, Resovia Rzeszów, Termalica Bruk-Bet Nieciecza
Sezon 2016/17:
- I miejsce młodzików w turnieju gminnym "Wakacje z Piłką Nożną"
- I miejsce młodzików w turnieju powiatowym "Wakacje z Piłką Nożną"
- I miejsce młodzików w turnieju subregionalnym "Wakacje z Piłką Nożną"
- III miejsce młodzików w Wojewódzkim Finale Turnieju "Wakacje z Piłką Nożną"
- mistrzostwo III ligi i awans drużyny trampkarzy do II ligi
- mistrzostwo II ligi i awans drużyny juniorów młodszych do I ligi
- występy drużyn skrzatów, żaków, orlików, młodzików, trampkarzy i juniorów młodszych
- rywalizacja z takimi drużynami jak Dynamo Mińsk, Tatran Presov, Ruch Chorzów, Termalica Bruk-Bet Nieciecza, Legia Warszawa
Sezon 2017/18:
- I miejsce młodzików w turnieju gminnym "Wakacje z Piłką Nożną"
- II miejsce młodzików w turnieju powiatowym "Wakacje z Piłką Nożną"
- mistrzostwo II ligi i awans drużyny trampkarzy do I ligi
- vicemistrzostwo II ligi i awans drużyny juniorów do I ligi
- awans drużyny młodzików do I ligi
- III miejsce orlików w turnieju Kryspinów Cup
- występy drużyn skrzatów, żaków, orlików, młodzików, trampkarzy i juniorów
- rywalizacja z takimi drużynami jak Sandecja Nowy Sącz, Wisła Kraków, Ruch Chorzów